社團法人台灣醫學生聯合會，最早係於1988年成立之第一個校際學生組織「中華民國醫學生聯合會」。經歷不斷演變，於2002年向內政部完成社會團體立案登記程序，登記名稱為「中華民國醫學生醫學人文交流協會」，復於2010年正式變更名稱為「台灣醫學生聯合會」，並於2018年向臺灣臺北地方法院完成社團法人登記，成為「社團法人台灣醫學生聯合會」。
2022年，本會與原屬本會獨立幹部群的「亞洲醫學生聯盟台灣協會」重新完成合併，並調整組織架構，期待以嶄新面貌迎接後疫情時代的挑戰，繼續邁向下一個35年。
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